莴笋病虫害不多，在生产上很少使用农药，但也有霜霉病、菌握病、病毒病、褐斑病等病害，以及蚜虫、红蜘蛛等虫害发生。在农业综合防治上，可采取如下措施：选用抗病品种；提倡与非菊科蔬菜、禾本科作物轮作2—3年；深翻土壤，加速病残体的腐烂分解，清除病株残体，打掉失去光合作用的底叶或病叶，携出田外；合理密植合理施肥，施足腐熟有机肥，开沟排水，增强田间通风透光，降低日间湿度；采用覆膜栽培，带土定植，地膜贴地或采用黑色地膜；夏毛栽培时，采用覆盖遮阳网或棚膜适当遮阳；露地种植采用与甜玉米或菜豆(4～6)：1间作，改善田间小气候；注意适时播种，出苗后小水勤灌，勿过分蹲苗。
霜霉病
是莴笋的主要病害。春莴笋、秋莴笋均有发生，尤以春季莴笋受害较重，在春莴笋封行时最易发生。
防治方法：
农业措施防治：选用抗病品种；轮作；适当控制栽植密度：施足底肥，增施磷钾肥，加强苗期水肥管理，开沟排水，灌水施肥采用沟灌等以降低田间湿度。莲座期及时预防，收获后清除病残体等。
灰霉病
该菌为害叶片和茎，叶片病斑初呈水浸状，扩大后呈不规则形灰褐色斑，湿度大时病部产生一层灰霉。茎部染病先在基部产生水浸状小斑，扩大后茎基部腐烂并生灰褐色或灰绿色霉层。高温干燥，病株逐渐干枯死亡； 潮湿条件下，病株从基部向上溃烂。
防治方法：
发病初期，喷洒50%溶菌灵可湿性粉剂600-700倍液，或28%灰霉立克可湿性粉剂600倍液，或50%灭霉灵可湿性粉剂600-800倍液，或50%腐霉利可湿性粉剂1500倍液，或40%灰霉菌核净悬浮剂1200倍液，或65%万霉灵可湿性粉剂1000倍液、或扑海因等。各药剂交替使用。视病情7-10天喷施1次，连续防治3-4次。
软腐病
高温、多雨、虫多、伤口多、黑腐病重以及地势低洼、播种较早、田间积水的地块，发病严重。
防治方法：
农业措施防治：选用抗病品种，如直立性品种的植株，茎基部水分容易蒸发，伤口易愈合，可减少病菌侵入；宜选择地势较高、灌排水条件好的地块，避免选用低洼易涝地块：实行轮作；基肥充分腐熟；铲除病株，病穴用石灰消毒。
菌核病
除危害莴笋外，也危害大白菜，甘蓝，萝卜、葱等蔬菜。其主要症状是地面茎基部先呈现水渍状褐色病斑，后向上扩展蔓延并腐烂，病部遍布白色丝状物和黑色鼠屎状大颗粒。病株叶片变黄枯萎。
防治方法：
实行3-4年轮作。用浓度为10%的盐水选种，除去混入种广中的菌核。深耕培，开沟排水，改善田间通风透光条什。
病毒病
莴笋染病后一般表现为花叶，严重的矮缩并黄化。汁液和桃蚜等进行非持久性传毒。
防治方法：
注意防治蚜虫，选用艾美乐、辟蚜雾等进行防治。或用金毒冠1000倍液防治、或50%多菌灵1000倍液。隔7-10天1次，连续防治3-4次。
