2015年以来，国家将现行的三项补贴（农作物良种补贴、种粮直补、农资综合补贴）合并为农业支持保护补贴，进一步优化补贴支持方向，突出耕地保护和粮食安全。试点工作已在部分地区展开，2016年要在全国推开。新的补贴政策如何保持与现有政策的衔接，存量资金和新增补贴资金如何向各类适度规模经营的新型农业经营主体倾斜，如何合理确定支持力度，这都是改革中将要解决的问题。
涉农补贴政策现状及问题
补贴项目种类多，工作效能提升难。现阶段已实施的种粮补贴种类主要有粮食直接补贴、农资综合补贴、良种补贴（分水稻、小麦、棉花、玉米、油菜），而且补贴标准不同。面对这么多的补贴项目，很多农户根本弄不懂补的是什么钱，哪一项补多少钱。由于每项补贴的政策目标不一样，计算补贴依据不尽相同，导致计算补贴面积存在数量上的不一致。补贴面积核实由不同部门负责，粮食直补和农资综合补贴由农工办负责，良种补贴由农业部门负责，导致重复核实面积，数据信息又不能共享。大量补贴信息采集工作由村会计来做，且一年至少有3次发放过程，每发放一项补贴，就要进行填报、审核、公示、上报等流程，对基层来说，工作量大且效率低。
实施环节操作难。江苏省的种粮补贴面积是以农业税计税面积和粮食实际种植面积相结合来定。由于粮食的实际种植面积难以有效准确核实等原因，在实际操作中还是以2001年税改确定的计税面积为依据，只进行了适度微调。实际种植面积与原来的计税面积有很大的差距，而粮食直补资金发放政策仍然要求以计税面积为依据。减少的面积还在享受粮食补贴，新增的面积却得不到补贴。据了解，少数地方对于高效设施农业面积、养殖用地、工业用地、建设用地并没有从国家种粮补贴面积中核减，导致种植面积和应补贴面积“两张皮”，成为诱发农村社会矛盾的热点问题。此外，国家要求在每年3月份之前就要将补贴资金及时发放到种粮农民手中，而这个时间农民到底要种植什么还不知道，因此对于种植面积，地方只能估计，造成与实际种植面积不符。
目标措施错位，补贴对象厘清难。现行国家种粮补贴政策的目的是鼓励农民种植粮食，扩大粮食种植面积，提高复种指数，增加粮食产量。种粮补贴目标应以土地承包者为发放对象。但目前农村土地承包流转现象非常普遍，而且绝大多数都是农户之间的私下行为，情况复杂，变化频繁。一味强调把补贴发给种粮农民，必然陷入补错对象的尴尬，影响农村稳定。
如何落实好新的农业补贴政策
新的农业补贴政策要想在基层落实扎实，应做到政策目标简明，补贴项目简单，便于操作。
今后农业补贴政策应当以农产品有效供给能力保护和建设为目标，无需以具体农业产品种植品种和农民生产收益为补贴对象。补贴受益人应为确保耕地用于主要农作物种植的土地承包权人。
新的补贴政策整合了补贴种类，简化为农业支持保护补贴，将80%的农资综合补贴存量资金，加上种粮农民直接补贴和农作物良种补贴资金，用于耕地保护。补贴对象为所有拥有耕地承包权的种地农民，享受补贴的农民要做到耕地不撂荒，地力不降低。补贴资金要与耕地面积或播种面积挂钩，并严格掌握补贴政策界限。对已作为畜牧养殖场使用的耕地、林地、成片粮田转为设施农业用地、非农业征（占）用耕地等已改变用途的耕地，以及长年抛荒、占补平衡中“补”的面积和质量达不到耕种条件的耕地等不再给予补贴。
建立以实际种植面积为依据的补贴机制，彻底消除补贴面积上的“两张皮”，明确核实面积的主体及责任，将核实面积和发放资金的责任分离。实行面积一次性核实统计、补贴一次性计算、资金一次性打卡，可大大减轻基层干部的工作量，也便于政府相关部门进行检查和监督。建立以农村土地承包确权面积为补贴依据的信息采集机制。农业补贴数据，包括耕地地力保护和扶持农业规模经营的补贴依据，可从信息系统中提取，再扣除渔业、林果业、养殖业及抛荒地等面积，最终确定农业补贴面积。补贴面积的增减依据主要是凭国土部门的批准和农经部门的验收文件等。实际补贴面积不再受税改面积的限制，无论是税改内面积还是税改以外面积，只要符合水稻、小麦、玉米等主要农作物栽培要求的耕地都要计入补助面积，杜绝一切形式的“两张皮”。即把新增平整造地种粮面积、退林还耕面积、退牧还耕面积和退鱼还耕面积计入补贴范围，给予地力保护补贴。扣减农民建房占用、工业园区征用、国家重点工程征用和农村社会公益事业占用等已经不再种植粮食的耕地，再核减渔业、林果业、养殖业用地以及抛荒地面积，不再给予地力保护补贴。
由于新的补贴政策不对特定粮食品种，享受补贴的面积不受夏秋两季农作物栽培周期影响，补贴信息的稳定性较强，真实性便于核查，自然减少矛盾滋生。补贴项目合并后，参与涉农补贴项目的部门就会减少，减少扯皮现象。如果补贴面积能从农村土地承包信息管理系统中提取相关数据，再实现涉农补贴系统与农村承包土地管理系统数据对接，那可进一步确保补贴数据的真实可靠，从而减少矛盾滋生。
