根据我国现行法律规定，城市市区土地归属于国家所有，农村和城市郊区的土地，宅基地和自留地、自留山属于农民集体所有，其他依法规定也属于国有土地。因此，城市房屋拆迁属于国有土地上建筑物的拆迁，应当适用国务院颁布的，我国2011年1月19日国务院第141次常务会议通过的，最新的《国有土地上房屋征收与补偿条例》。而农村宅基地拆迁隶属集体土地征用中房屋拆迁范畴，适用的是有关征地补偿安置的《土地管理法》规定。
经由以上介绍我们不难看出，首先城市房屋拆迁和农村宅基地拆迁两者性质不同，分别隶属于不同的主管部门，房屋拆迁管理部门和土地管理部门。
其次两者补偿标准不同。根据现行法律《国有土地上房屋征收与拆迁补偿条例》，城市拆迁补偿是按市场评估价进行，城市房屋寸土寸金，补偿主要依据区位，用途和建筑面积确定，农村宅基地则主要分为宅基地的补偿和地上物的补偿，一般只补偿成本重置费。因此城市拆迁补偿自然要比宅基地征收补偿价格高得多。于是，在进行征地补偿时究竟是用何种补偿安置标准，便成为被拆迁人和拆迁公司的主要争论焦点之一。
最后是两者实施主体不同。农村宅基地拆迁的实施主体一般是市县国土资源部门，而城市房屋拆迁一般是由政府委托的拆迁公司等进行。
