公的一般体形略长，而母的身体较短且圆；公的生殖器小而狭长，呈凹形，而母的生殖器大而略圆，向外凸起；公的一般颜色鲜艳，而母的略淡一些；公的腹部有一条明显的硬线，母的则腹部较软；公的游动速度快而且敏捷，母的动作则慢一些。
1、体形的差别：雄性鱼一般体形略长，雌性鱼身体较短且圆。怀卵期雌鱼较雄鱼腹部膨大。
2、尾柄的差别：雄鱼比雌鱼略粗壮。
3、胸鳍的差别：细心观察可发现，雄鱼稍尖长，胸鳍第一根鳍刺较粗硬；雌鱼呈短圆形，胸鳍第一根鳍刺不太硬。
4、生殖器的差别：由肚皮向上看，雄鱼生殖器小而狭长，呈凹形；雌鱼生殖器大而略圆，向外凸起。
5、色泽的区别：雌雄不同的金鱼，在体色上略有差异，雄鱼一般颜色鲜艳，而雌鱼略淡一些，在繁殖发育期，雄鱼体色更为鲜艳。
6、手感与动感：用手轻托鱼的腹部，中指和无名指感触到雄鱼腹部有一条明显的硬线，雌鱼则腹部较软。走过鱼池边时，猛踏脚观察，雄鱼游动速度快而且敏捷，雌鱼动作则慢一些。
7、追星：随着气温的升高，鱼在产卵期会出现第二特征--追星，这是辨别鱼性别最容易、最准确的时候，也是最容易掌握的一种辨别方法。雄鱼的追星出现在胸鳍第一根刺和鳃盖边缘，多时整个胸鳍每个鳍条上都长有追星，前端的明显，后面的要仔细才可以观察到。这种粗糙的小白点就是追星。
总结：除了运用以上辨别方法，还必须依靠有多年饲养的经验和平时细心观察，才能准确的小锦鲤的公母。
